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PN運輸至小腸粘膜并到血流中，也可在腸粘膜中合成PNP，約為劑量30.6%，血流中PN可擴散到肌肉中，然后磷酸化約占劑量的10.4%～15.7%。在人體給以PN后，血漿PL可以增加12倍，血漿中PLP雖占血漿中維生素B6的60%，但與蛋白相結合，不易為其他細胞所利用。血漿中PL與白蛋白結合不牢固，為運輸?shù)男问?，能被組織攝取與清除，并氧化為PA。PN及PL通過擴散進入到紅細胞中，并為激酶磷酸化。人的紅細胞可將PNP氧化PLP，其他動物如大鼠無此功能。PN在超過紅細胞PL激酶飽合濃度時，可在3～5min進入到紅細胞中，細胞內的濃度與培養(yǎng)基濃度一致。PL在濃度超過紅細胞磷酸激酶的濃度時，進入紅細胞的量增加，使其濃度比培養(yǎng)基中要高這是由于PL與血紅蛋白α-鏈中末端纈氨酸相結合，所以PL在紅細胞中積累，它在紅細胞中的濃度可為血漿中之4～5倍。紅細胞中的PL可能也是一種運輸方式。
肝也是維生素B6代謝活躍的組織。PN為肝細胞納入后，相繼為PL激酶及PNP氧化酶作用而生成PLP，然后再經磷解作用而轉變?yōu)镻L，進入循環(huán)系統(tǒng)中，運至有磷酸激酶的組織形成PLP。
在腦切片及分離脈絡叢中，沒有PN，均是磷酸化合物、脈絡叢為運輸PN從血到腦脊液的場所。在維生素B6缺乏的動物（大鼠）PL激酶有所下降，飼料5周的大鼠肝中，PL肝激酶下降50%而腦中僅下降14%。這也說明維生素B6對神經系統(tǒng)的重要性。
儲存

維生素B6在血流中可擴散到肌肉中而磷酸化，若PN劑量增加，肌肉中PN占劑量的百分數(shù)增加，而PNP的百分數(shù)減少。在肌肉中未發(fā)現(xiàn)PNP氧化到PLP。在大鼠60%維生素B6在肌肉中，其中75%～95%與糖原磷酸化酶（Glycogenphosphorylase）相。此酶占肌肉可溶性蛋白之5%，可能為維生素B6的儲存場所。通過肌肉蛋白的轉換，將維生素B6分解出來以滿足zui低需要量。
排出

維生素B6的主要代謝產物PA，可代表維生素B6攝取入量的20%～40%，尿中PA只可為攝入量的指標。而不能代表體內的儲存。尿中除PA外，尚有小量的PN、PL等。給以生理劑量時，在3h內大部分以PA排出。PN在腎小管中積累，當PN濃度較大時，可由腎排出。因此PN劑量10mg時，尿中PA占劑量的百分數(shù)減低，但PN的排出增多。PL不易被腎排除，也不易被腎納入，納入后以磷酸化形式積累。但人口服大劑量（100mg）PL、PM、PN后，在36h內大部分原物從尿中排出。

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